Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm8513-201ENSMUST00000182830 1003 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm28274-202ENSMUST00000187775 1157 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm28202-203ENSMUST00000189780 1157 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd11P23813 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms