Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HdcP23738 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HdcP23738 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HdcP23738 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HdcP23738 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HdcP23738 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HdcP23738 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HdcP23738 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HdcP23738 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HdcP23738 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HdcP23738 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HdcP23738 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms