Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csn1s1P19228 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csn1s1P19228 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms