Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpraP18052 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpraP18052 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtpraP18052 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpraP18052 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms