Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxb1P17919 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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