Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sptan1P16546 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sptan1P16546 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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