Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd44P15379 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd44P15379 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms