Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scd1P13516 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms