Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rb1P13405 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms