Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spp1P10923 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms