Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmem254bP0DN90 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms