Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Amd1P0DMN7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Amd1P0DMN7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms