Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Becn2P0DM65 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms