Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TtrP07309 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TtrP07309 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TtrP07309 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtrP07309 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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