Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfrbP05622 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms