Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxa7P02830 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms