Protein–RNA interactions for Protein: P01819

Ig heavy chain V region MOPC 141, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01819 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01819 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01819 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01819 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01819 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms