Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01662 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01662 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01662 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01662 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms