Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P01661 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P01661 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01661 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01661 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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