Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01648 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01648 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01648 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01648 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01648 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01648 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01648 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01648 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms