Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ShdO88834 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ShdO88834 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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ShdO88834 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ShdO88834 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ShdO88834 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ShdO88834 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ShdO88834 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ShdO88834 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms