Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcn2O88703 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcn2O88703 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms