Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BlmO88700 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BlmO88700 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BlmO88700 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BlmO88700 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BlmO88700 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BlmO88700 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BlmO88700 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BlmO88700 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BlmO88700 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BlmO88700 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms