Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ClppO88696 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClppO88696 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClppO88696 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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