Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops6O88545 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Cops6O88545 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cops6O88545 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cops6O88545 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms