Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Dnmt3bO88509 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dnmt3bO88509 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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