Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AvilO88398 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AvilO88398 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AvilO88398 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AvilO88398 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AvilO88398 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms