Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Tnnt1O88346 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnnt1O88346 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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