Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb5O70309 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms