Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trappc3O55013 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc3O55013 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms