Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NfkbieO54910 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NfkbieO54910 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms