Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TsksO54887 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TsksO54887 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TsksO54887 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TsksO54887 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TsksO54887 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TsksO54887 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TsksO54887 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TsksO54887 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TsksO54887 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TsksO54887 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TsksO54887 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms