Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffbO54788 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffbO54788 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffbO54788 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffbO54788 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffbO54788 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffbO54788 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffbO54788 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffbO54788 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DffbO54788 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
DffbO54788 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DffbO54788 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DffbO54788 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DffbO54788 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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