Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Limk2O54785 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Limk2O54785 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms