Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Srpk2O54781 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Srpk2O54781 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms