Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cavin1O54724 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms