Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc4O35988 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc4O35988 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms