Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FxnO35943 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FxnO35943 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FxnO35943 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FxnO35943 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FxnO35943 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FxnO35943 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FxnO35943 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FxnO35943 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FxnO35943 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FxnO35943 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FxnO35943 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FxnO35943 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FxnO35943 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FxnO35943 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FxnO35943 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FxnO35943 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FxnO35943 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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FxnO35943 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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