Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bnc1O35914 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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