Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf18O35714 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf18O35714 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms