Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc27a2O35488 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms