Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xbp1O35426 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xbp1O35426 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms