Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna3O35344 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna3O35344 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna3O35344 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna3O35344 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna3O35344 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna3O35344 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna3O35344 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna3O35344 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna3O35344 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna3O35344 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna3O35344 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna3O35344 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna3O35344 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna3O35344 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms