Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smad6O35182 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smad6O35182 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smad6O35182 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms