Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-Q1O19441 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-Q1O19441 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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