Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Casq1O09165 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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