Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf6O08584 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf6O08584 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms