Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm3239L7N2D9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms