Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmn2r88L7N1W8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Vmn2r88L7N1W8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Vmn2r88L7N1W8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r88L7N1W8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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