Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms